新疆医科大学厚博学院是2003年5月6日获准成立， 2004年2月5日由国家教育部教发函〔2004〕13号文件确认的，由新疆医科大学举办的、充分依托大学优质教育资源和办学优势的独立学院。 根据国家教育部和自治区教育厅相关文件，厚博学院组建了董事会和监事会，并按照“应具有独立的校园和基本办学设施”的要求，实施相对独立的教学组织和管理。具有独立法人资格，进行相对独立的招生，独立颁发学历证书，独立进行财务核算，独立填报《高等教育基层统计报表》，并能独立承担民事责任。 厚博学院占地314.80亩（2007年，新疆医科大学向厚博学院划拨教学用地和教学行政用房），总建筑面积达8万余平方米，包括2栋学生公寓楼、1栋教学楼、1栋学生食堂，截至2009年底，总固定资产7558.96万元，基本满足了教育教学工作的需要。（基本为两个学院共用）。 目前厚博学院有临床医学、中西医临床医学、口腔医学、医学影像学、医学检验、药学、医学生物技术、护理学、信息管理与信息系统、卫生事业管理等10个本科专业，涉及医学、理学、管理学等三个专业门类。目前在校生人数为3395人，5年来在校生年平均规模为3000人。